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Registro completo
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Biblioteca (s) : |
INIA Las Brujas. |
Fecha : |
27/04/2021 |
Actualizado : |
27/04/2021 |
Tipo de producción científica : |
Artículos en Revistas Indexadas Internacionales |
Autor : |
SIMEONE, M.; GÓMEZ, C.; BERTALMIO, A.; RUIZ, E.; HAUTEVILLE, C.; GODOY, L.; TITO, B.; GARCÍA, M.L. |
Afiliación : |
MELINA SIMEONE, Instituto de Biotecnología y Biología Molecular, CCT-La Plata CONICET-UNLP Facultad de Ciencias Exactas, UNLP, La Plata, Argentina; CLAUDIO GÓMEZ, Estación Experimental Agropecuaria Concordia, Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA), Entre Ríos, Argentina; ANA MARIA BERTALMIO CASARIEGO, INIA (Instituto Nacional de Investigación Agropecuaria), Uruguay; ESPERANZA RUIZ, Laboratorio de Investigación y Desarrollo de Bioactivos, Facultad de Ciencias Exactas, UNLP, La Plata, Argentina; CLAUDIA HAUTEVILLE, Estación Experimental Agropecuaria Concordia, Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA), Entre Ríos, Argentina; LAURA GODOY SUÁREZ, Estación Experimental Agropecuaria Concordia, Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA), Entre Ríos, Argentina; BLAS TITO, Estación Experimental Agropecuaria Concordia, Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA), Entre Ríos, Argentina; MARÍA L. GARCÍA, Instituto de Biotecnología y Biología Molecular, CCT?La Plata CONICET?UNLP Facultad de Ciencias Exactas, UNLP, La Plata, Argentina. |
Título : |
Detection of citrus psorosis virus by RT‐qPCR validated by diagnostic parameters. |
Fecha de publicación : |
2021 |
Fuente / Imprenta : |
Plant Pathology, May 2021, Volume 70, Issue 4, Pages 980-986. Doi: https://doi.org/10.1111/ppa.13341 |
ISSN : |
0032-0862 |
DOI : |
10.1111/ppa.13341 |
Idioma : |
Inglés |
Notas : |
Article history: Received, 8 September 2020; Accepted, 28 December 2020, First published, 18 January 2021.
This work was supported by Agencia Nacional de Promoción Científica y Tecnológica (ANPCYT) PICT 2014‐1007 and PICT Start UP 2014‐3762, Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas (CONICET) Proyectos de Investigación de Unidades Ejecutoras?(IBBM), Universidad Nacional de La Plata (UNLP) X‐692, and Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA) (PNFRU‐1172; 11721; ERIOS‐630081, PD I081 and RIST I091). M.S. was supported by ANPCyT and CONICET. M.L.G. belongs to CONICET and Departamento de Ciencias Biológicas, Facultad de Ciencias Exactas, UNLP. We thank Beatriz Stein and Julia Figueroa from the Estación Experimental Agroindustrial Obispo Colombres (EEOC), Tucumán, for providing samples from their collection and Magalí Gabrielli for technical assistance in the total RNA extractions. We thank Pedro Moreno for helpful discussion and critical reading of the manuscript. |
Contenido : |
ABSTRACT.
Citrus psorosis virus (CPsV) is the causal agent of psorosis, an important disease of citrus. Sanitary and certification programmes helped reduce disease damage caused by psorosis and other graft‐transmissible diseases in many citrus‐growing regions. For quarantine and certification programmes, most of these diseases are currently diagnosed using biological indexing (BI) on sensitive indicator plants. In the case of citrus psorosis, CPsV can be detected by molecular methods such as quantitative reverse transcription PCR (RT‐qPCR), which is cheaper and faster than BI, but sensitivity, reliability, and reproducibility of both procedures have not been compared so far. In this work, 128 plants from Argentina and Uruguay were analysed using BI and CPsV detection by the RT‐qPCR assay. Almost perfect agreement between both diagnostic procedures and sensitivity, specificity, and estimated likelihood ratios indicate that RT‐qPCR is equivalent to BI for citrus psorosis diagnosis, thus providing confidence in the quick diagnostic procedure to monitor the sanitary status of citrus trees.
© 2021 British Society for Plant Pathology |
Palabras claves : |
Citrus psorosis virus; Diagnostic parameters; RT-qPCR. |
Asunto categoría : |
H20 Enfermedades de las plantas |
Marc : |
LEADER 03027naa a2200277 a 4500 001 1061995 005 2021-04-27 008 2021 bl uuuu u00u1 u #d 022 $a0032-0862 024 7 $a10.1111/ppa.13341$2DOI 100 1 $aSIMEONE, M. 245 $aDetection of citrus psorosis virus by RT‐qPCR validated by diagnostic parameters.$h[electronic resource] 260 $c2021 500 $aArticle history: Received, 8 September 2020; Accepted, 28 December 2020, First published, 18 January 2021. This work was supported by Agencia Nacional de Promoción Científica y Tecnológica (ANPCYT) PICT 2014‐1007 and PICT Start UP 2014‐3762, Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas (CONICET) Proyectos de Investigación de Unidades Ejecutoras?(IBBM), Universidad Nacional de La Plata (UNLP) X‐692, and Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA) (PNFRU‐1172; 11721; ERIOS‐630081, PD I081 and RIST I091). M.S. was supported by ANPCyT and CONICET. M.L.G. belongs to CONICET and Departamento de Ciencias Biológicas, Facultad de Ciencias Exactas, UNLP. We thank Beatriz Stein and Julia Figueroa from the Estación Experimental Agroindustrial Obispo Colombres (EEOC), Tucumán, for providing samples from their collection and Magalí Gabrielli for technical assistance in the total RNA extractions. We thank Pedro Moreno for helpful discussion and critical reading of the manuscript. 520 $aABSTRACT. Citrus psorosis virus (CPsV) is the causal agent of psorosis, an important disease of citrus. Sanitary and certification programmes helped reduce disease damage caused by psorosis and other graft‐transmissible diseases in many citrus‐growing regions. For quarantine and certification programmes, most of these diseases are currently diagnosed using biological indexing (BI) on sensitive indicator plants. In the case of citrus psorosis, CPsV can be detected by molecular methods such as quantitative reverse transcription PCR (RT‐qPCR), which is cheaper and faster than BI, but sensitivity, reliability, and reproducibility of both procedures have not been compared so far. In this work, 128 plants from Argentina and Uruguay were analysed using BI and CPsV detection by the RT‐qPCR assay. Almost perfect agreement between both diagnostic procedures and sensitivity, specificity, and estimated likelihood ratios indicate that RT‐qPCR is equivalent to BI for citrus psorosis diagnosis, thus providing confidence in the quick diagnostic procedure to monitor the sanitary status of citrus trees. © 2021 British Society for Plant Pathology 653 $aCitrus psorosis virus 653 $aDiagnostic parameters 653 $aRT-qPCR 700 1 $aGÓMEZ, C. 700 1 $aBERTALMIO, A. 700 1 $aRUIZ, E. 700 1 $aHAUTEVILLE, C. 700 1 $aGODOY, L. 700 1 $aTITO, B. 700 1 $aGARCÍA, M.L. 773 $tPlant Pathology, May 2021, Volume 70, Issue 4, Pages 980-986. Doi: https://doi.org/10.1111/ppa.13341
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Registro original : |
INIA Las Brujas (LB) |
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Biblioteca (s) : |
INIA La Estanzuela; INIA Las Brujas; INIA Tacuarembó; INIA Treinta y Tres. |
Fecha actual : |
02/04/2020 |
Actualizado : |
15/04/2020 |
Tipo de producción científica : |
Revista INIA |
Autor : |
INIA (INSTITUTO NACIONAL DE INVESTIGACIÓN AGROPECUARIA) |
Título : |
Revista INIA Uruguay. (N° 60, Marzo 2020). |
Fecha de publicación : |
2020 |
Fuente / Imprenta : |
Montevideo (UY): INIA, 2020. |
Páginas : |
100 p. |
Serie : |
(Revista INIA; 60) |
ISSN : |
1510-9011 |
Idioma : |
Español |
Contenido : |
Informe especial: Forestación en Uruguay. La visión y el aporte de INIA a un sector en crecimiento. |
Thesagro : |
ARROZ; BIOTECNOLOGIA; BOVINOS DE CARNE; CAMBIO CLIMÁTICO; CIENCIA; CITRUS; CLIMATOLOGIA; COMUNICACIÓN; CONTROL DE ENFERMEDADES; CULTIVO; CULTIVOS DE GRANO; CULTIVOS DE SECANO; ENTOMOLOGIA; ESPECIES FORRAJERAS; EUCALYPTUS; EXPLOTACION AGRICOLA FAMILIAR; FITOPATOLOGÍA; FORESTALES; FORRAJERAS; FORRAJES; FRUTALES; FRUTICULTURA; GANADO BOVINO; GRANOS; GRAS; HORTALIZAS; HORTICULTURA; IMAGEN CORPORATIVA & COMUNICACIÓN INSTITUCIONAL; INIA; INNOVACION; INVESTIGACIÓN; LECHERÍA; LEGUMINOSAS; MANEJO DE CULTIVOS; MEJORAMIENTO ANIMAL; METEOROLOGIA; MICROBIOLOGÍA; OVINOS; PASTURAS; PRODUCCIÓN ANIMAL; PRODUCCION DE LANA; PRODUCCION DE LECHE; REVISTA INIA 2020; SEMILLAS; SUELOS; SUSTENTABILIDAD AMBIENTAL; TECNOLOGIA; TRANSFERENCIA DE TECNOLOGIA; VARIEDADES; VITICULTURA. |
Asunto categoría : |
A50 Investigación agraria |
URL : |
http://www.ainfo.inia.uy/digital/bitstream/item/14360/1/Revista-INIA-60-Marzo-2020.pdf
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Marc : |
LEADER 02046nam a2200745 a 4500 001 1060985 005 2020-04-15 008 2020 bl uuuu u00u1 u #d 022 $a1510-9011 100 1 $aINIA (INSTITUTO NACIONAL DE INVESTIGACIÓN AGROPECUARIA) 245 $aRevista INIA Uruguay. (N° 60, Marzo 2020).$h[electronic resource] 260 $aMontevideo (UY): INIA$c2020 300 $a100 p. 490 $a(Revista INIA; 60) 520 $aInforme especial: Forestación en Uruguay. La visión y el aporte de INIA a un sector en crecimiento. 650 $aARROZ 650 $aBIOTECNOLOGIA 650 $aBOVINOS DE CARNE 650 $aCAMBIO CLIMÁTICO 650 $aCIENCIA 650 $aCITRUS 650 $aCLIMATOLOGIA 650 $aCOMUNICACIÓN 650 $aCONTROL DE ENFERMEDADES 650 $aCULTIVO 650 $aCULTIVOS DE GRANO 650 $aCULTIVOS DE SECANO 650 $aENTOMOLOGIA 650 $aESPECIES FORRAJERAS 650 $aEUCALYPTUS 650 $aEXPLOTACION AGRICOLA FAMILIAR 650 $aFITOPATOLOGÍA 650 $aFORESTALES 650 $aFORRAJERAS 650 $aFORRAJES 650 $aFRUTALES 650 $aFRUTICULTURA 650 $aGANADO BOVINO 650 $aGRANOS 650 $aGRAS 650 $aHORTALIZAS 650 $aHORTICULTURA 650 $aIMAGEN CORPORATIVA & COMUNICACIÓN INSTITUCIONAL 650 $aINIA 650 $aINNOVACION 650 $aINVESTIGACIÓN 650 $aLECHERÍA 650 $aLEGUMINOSAS 650 $aMANEJO DE CULTIVOS 650 $aMEJORAMIENTO ANIMAL 650 $aMETEOROLOGIA 650 $aMICROBIOLOGÍA 650 $aOVINOS 650 $aPASTURAS 650 $aPRODUCCIÓN ANIMAL 650 $aPRODUCCION DE LANA 650 $aPRODUCCION DE LECHE 650 $aREVISTA INIA 2020 650 $aSEMILLAS 650 $aSUELOS 650 $aSUSTENTABILIDAD AMBIENTAL 650 $aTECNOLOGIA 650 $aTRANSFERENCIA DE TECNOLOGIA 650 $aVARIEDADES 650 $aVITICULTURA
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